南瓜不仅有较高的食用价值。而且有着不可忽视的食疗作用。据《滇南本草》载：南瓜性温，味甘无毒，入脾、胃二经，能润肺益气，化痰排脓，驱虫解毒，治咳止喘，疗肺痈便秘，并有利尿、美容等作用。南瓜中还含有丰富的锌，参与人体内核酸、蛋白质的合成是肾上腺皮质激素固有成分，为人体生长发育的重要物质。南瓜中对人体的有益成分有：多糖、氨基酸、活性蛋白、类胡萝卜素及多种微量元素等。
南瓜含维生素C分解酶，所以南瓜不宜与含维C的蔬菜瓜果配吃。